ピリミジン塩基が肝臓の分解酵素によって水溶性のβアラニン、βアミノイソ酪酸、CO_２、NH_３となります。これらの物質は水溶性で排泄されやすいため、過剰摂取が問題になることはありません。

ピリミジンヌクレオチドの合成と分解

ピリミジンヌクレオチドの生合成

・ピリミジンはアミノ酸の１種であるグルタミンから生合成が始まります。
・ＡＴＰや重炭酸イオン（ＨＣＯ_３^―）を用いて、酵素の働きにより、カルバモイルリン酸を作ります。
・カルバモイルリン酸にアミノ酸の１種であるアスパラギン酸がカルバモイルリン酸のリン酸の付いていた部分に結合してリン酸がとれ、カルバモイルアスパラギン酸となります。
・次にジヒドロオロト酸となり、キノンによって水素が奪われて、オトロ酸というピリミジン環の元になる構造ができあがります。
・合成されたオトロ酸はＰＲＰＰと結合し、オロチジル酸（ＯＭＰ）となります。
・オロチジル酸は脱炭酸（ＣＯ_２が外れる）をうけてＵＭＰになります。ＵＭＰ（ウリジル酸）が全てのピリミジンヌクレオチドの前駆体になります。
・ＵＭＰはＵＤＰとなり、その後ＣＴＰ/ｄＣＴＰあるいはｄＵＭＰができます。
・ｄＵＭＰはチミジル酸シンターゼでチミジル酸（ｄＴＭＰ）となり、その後ｄＴＴＰ（ＴＴＰ）が生成されます。
・ピリミジンの異化
・ピリミジン塩基は開裂されたのち窒素はアンモニアを生成するとともに、尿素回路で処理されるため、尿酸を作る心配はありません。
・シトシンとウラシルの炭素骨格はアセチルＣｏＡに、チミンの炭素骨格はスクシニルＣｏＡ（クエン酸回路の中間体）になります。つまりピリミジンはエネルギー源として活用できます。
・再利用経路ではチミンがチミジン合成酵素でチミジンとなり、リン酸化されてｄＴＭＰとなります。